A banda de les diferents especialitats mèdiques, l’Hospital Sant Rafael disposa dels següents serveis centrals i adscrits:

• Gestió de fluxos i pacients
• Admissions
• Farmàcia hospitalària
• Rehabilitació física
• Diagnòstic imatge/raigs X
• Anàlisis clíniques
• Anatomia patològica
• Unitat de bioètica
• Qualitat i seguretat del pacient
• Atenció a l’usuari - Treball social
• Documentació clínica i arxius
• Anestesia
• Neurofisiologia